Sebagai upaya peningkatan manajemen tata kelola organisasi dan sistem akademik, Pascasarjana IAIN Kudus melaksanakan kunjungan akademik dan keorganisasian ke Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan (FITK) UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta dan Pascasarjana UIN Raden Mas Said Surakarta. Dalam kunjungan tersebut Direktur Pascasarjana IAIN Kudus, Prof. Dr. M. Nur Ghufron, S.Ag., M.Si., menyampaikan progres akademik dan organisasi di Pascasarjana IAIN Kudus. Kunjungan akademik dan organisasi ini dilaksanakan untuk mencari formulasi produktif yang bisa dikembangkan di Pascasarjana IAIN Kudus setelah dibukanya Program Doktor Studi Islam. Hal ini sebagaimana juga dijelaskannya tentang masa tunggu terbitnya KMA Program Doktor Manajemen Pendidikan Islam yang sudah terlaksana Assestment Lapangan pada beberapa bulan berlalu. Penjelasan serupa juga disampaikan oleh Prof. Ghufron kepada Direktur Pascasarjana UIN Raden Mas Said Surakarta yang juga pada perjalanannya sedang menunggu proses submit Proposal S3 Studi Islam di Pascasarjana UIN Surakarta.